临床医学南山班 2010年经教育部批准开设临床医学统筹实验班“南山班”，2012年入选教育部第一批卓越医生教育培养计划项目，2013年获批广东省高等学校试点学院，2015年获批广东省拔尖创新医学人才培养项目。南山班坚持以“南山精神”为引领，积极践行“IMH”[I是Innovation（创新），M是Mission（使命），H是Humanity（人文）]人才培养理念，由“共和国勋章”获得者钟南山院士亲自担任班主任，全面实施“选拔制、学长制、导师制，小班小组化、国际化、个性化，融合器官系统疾病课程体系、融合临床实践和科研创新体系、融合育人团队”等特色拔尖创新医学人才培养模式改革。南山班构建了“以疾病为中心”的“基础-临床-预防-人文多学科+”纵横贯通的器官系统整合课程体系，充分依托广州医科大学、广州实验室、国家呼吸医学中心、呼吸疾病全国重点实验室等优质资源平台和导师资源，实施高层次人才为主体的全员全程导师制并组成“高水平导师-研究生-本科生”科研创新学术共同体，以科研项目为驱动，实现学生科研实践100%“三早”；充分利用剑桥大学、香港李嘉诚医学院等全球性优质资源，实现南山班学生100%国际化交流培养，助力具有持续发展能力的拔尖创新型临床医学人才的成长成才。

2024年开始临床医学“5+X”一体化招生，开展临床医学本硕博贯通培养。

基础医学南山班 基础医学南山班汇聚中国工程院院士、国家杰出青年科学基金获得者等高水平师资团队，以广州国家实验室、呼吸疾病全国重点实验室等国家级科研平台为支撑，构建“基础-临床贯通融合、医工文理多学科交叉”的特色培养体系。本班采用“5+5”本-硕博两段式培养模式，全程配备学业导师和学术导师进行“一对一”指导。专业通过“小班化”教学、“研究型”课程和“国际化”培养（英国爱丁堡大学、澳大利亚西澳大学、新加坡南洋理工大学等海外研学项目），致力于培养具有深厚医学与生命科学理论基础、卓越科研创新能力及全球视野的拔尖人才。2024年，基础医学“南山”拔尖人才培养创新试验区获批广东省基础学科拔尖人才培养创新实验区，开展“5+X”一体化招生，综合保研率高达60%，优秀学生可免试进入硕博连读，为未来医学领域的科学家、学科领军人才和交叉创新研究者提供成长沃土。

生物技术英才班 依托“广东省基础学科拔尖人才培养创新实验区”建设，与呼吸疾病全国重点实验室、广州实验室共同培养，构建校院协同育人“4+X”本研一体化培养模式，实行个性化教育，培养契合呼吸生物学领域国家重大战略需求和粤港澳大湾区健康领域发展需要，掌握系统而扎实的生物科学与技术相关基本知识、基础理论及基本技能，毕业后可在呼吸病学及相关领域科研院所及机构从事科学研究、技术创新的生物技术拔尖创新人才。

生物技术卓越班 由广州医科大学与中国科学院广州生物医药与健康研究院联合办学，旨在通过校院协同“2+2”培养模式，培养掌握扎实的生物科学及技术相关基本知识、基础理论及基本技能，毕业后可在再生医学及相关领域科研院所及机构从事科学研究、技术创新的研究卓越型人才。

医学检验技术创新班 金域检验学院是国家首批现代产业学院，依托国家级教学平台、科研平台和广泛的医检产业资源，构建了校企协同育人的人才培养体系。通过实施学业导师和行业导师联合的双导师制度，个性化培养创新拔尖人才、形态学方向专项人才和新技术应用特色人才。致力于培养具有人文情怀、精于实践、敢于创新和国际视野的一流医学本科高素质医学检验复合型人才。

药学卓越班 是广东省创新强校工程项目“药学专业综合改革试点”，依托药学复合型人才培养实验区平台，以个性化培养的一对一导师制为特色，紧扣新药研发全链条进行人才培养。目前已与境外多所高校（新加坡国立大学、香港大学、香港中文大学、香港浸会大学、澳门科技大学、英国伯明翰大学、美国圣约翰大学）开展了夏令营等多种形式的联合人才培养。从2025年开始，卓越班由广州医科大学-中国科学院中山药物创新研究院联合共建，通过一学年的深度科研培训，打造具有国际视野和新药研发基本技能的拔尖创新人才。

临床药学创新班 以智慧临床药学为特色，聚焦临床药学服务能力（突显外科药学、胸腔疾病治疗药物管理、神经精神药物治疗监测和妇儿特殊人群安全用药等领域），并以“科研与教学融合”、“基础与临床共建”为抓手，依托强大的附属医院临床医药资源，实现校本部学术导师与附属医院临床导师“双导师”，“学术+实践”双轮驱动、职业药师规范化培训、本硕一体化贯通培养等方式，塑造具有较强的科研能力、国际视野和人文情怀，毕业后能够胜任临床药学服务、新药临床研究和评价、临床精准用药指导以及药品监管工作的拔尖创新人才。

预防医学卫生应急特色班 由广州医科大学-广州市疾病预防控制中心深度合作协同育人，整合学校和行业机构的优质资源，对专业课程体系进行全新模块化教学改革，实行高校与行业机构双导师指导，加强创新能力和执业能力培养，通过“学中干、干中学”培养契合粤港澳大湾区建设需求，掌握预防医学知识、技能和行业动态，具有创新创业能力和卫生应急能力的高素质预防医学专业人才。

生物医学工程 是医工交叉创新的前沿阵地，该专业依托国家实验室及附属医院的尖端资源，实施学校-企业-医院-孵化器全链条协同育人，开展以成果为导向的新工科卓越人才培养。专业聚焦智能医疗仪器、智能医学信息和生物医学材料三大前沿交叉方向，以“广医-广实创新特训营”等特色实践项目为抓手，学生可深度参与从临床需求洞察到产品落地的全过程，培养出服务健康中国战略、契合粤港澳大湾区生物医药与医疗器械产业发展需求、具备卓越创新能力、既懂医学又精工程的复合型高素质人才。